(一)費(fèi)氏弧菌發(fā)光桿菌材料與方法的選擇
臨床常見(jiàn)的標(biāo)本有血液、尿液、唾液、組織及培養(yǎng)細(xì)胞等;核酸分離與純化的方法非常多,如何恰當(dāng)?shù)厥占c準(zhǔn)備材料,選擇適宜的分離與純化方法是一個(gè)首要的問(wèn)題。首先我們應(yīng)當(dāng)明確核酸的分離與純化并不是zui終的目的,不同的實(shí)驗(yàn)研究與應(yīng)用對(duì)核酸的產(chǎn)量、完整性、純度和濃度可能有不同的要求;至于分離與純化核酸所需的時(shí)間與成本也往往需要考慮;在不影響核酸質(zhì)量的情況下,應(yīng)選擇安全無(wú)毒的試劑與方案。
(二)選擇的原則
核酸分離與純化的方法很多,應(yīng)根據(jù)具體生物材料的性質(zhì)與起始量、待分離核酸的性質(zhì)與用途而采取不同的方案。無(wú)論采取何種方法,都應(yīng)遵循總的原則:一是保證核酸一級(jí)結(jié)構(gòu)的完整性,因?yàn)橥暾囊患?jí)結(jié)構(gòu)是核酸結(jié)構(gòu)和功能研究的zui基本的要求;二是盡量排除其它分子的污染,保證核酸樣品的純度,這是本章討論的主要內(nèi)容。
(三)核酸完整性的保持
為了保證核酸的完整性,在操作過(guò)程中,首先應(yīng)盡量避免各種有害因素對(duì)核酸的破壞。影響核酸完整性的因素很多,包括物理、化學(xué)與生物學(xué)的因素,其中有些是可以避免的。如過(guò)酸或過(guò)堿,對(duì)核酸鏈中的磷酸二酯鍵有破壞作用,費(fèi)氏弧菌發(fā)光桿菌在核酸的提取過(guò)程中,采用適宜的緩沖液,始終控制pH在4~10之間,就可以很好地避免其危害;另外如高溫加熱,除高溫本身對(duì)核酸分子中的化學(xué)鍵的破壞作用外,還可能因煮沸帶來(lái)液體剪切力,因此核酸提取常常在0~4℃的條件下進(jìn)行。
其次對(duì)無(wú)法避免的有害因素,應(yīng)采取多種措施,盡量減輕各種有害因素對(duì)核酸的破壞。應(yīng)盡量簡(jiǎn)化分離純化的步驟,縮短提取的時(shí)間,減輕各種有害因素對(duì)核酸完整性的破壞; DNA酶(DNase或DNAase)的激活需要Mg2+、Ca2+等二價(jià)金屬離子,費(fèi)氏弧菌發(fā)光桿菌若使用EDTA、檸檬酸鹽并在低溫條件下操作,基本上就可以抑制DNA酶的活性。RNA酶(RNase或RNAase)的廣泛存在與不易失活的特點(diǎn),決定了生物降解是RNA提取過(guò)程中的主要危害因素。
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